Родился в селе Вагай Тюменской области. Выпускник Карагайской средней школы с золотой медалью. В 2005 году с отличием окончил Тюменское высшее военно-инженерное училище. Прошел путь от командира взвода до командира полка.
Участник контртеррористической операции на Северном Кавказе (Вторая чеченская война). В 2019 году окончил Общевойсковую академию ВС РФ. Профессионал инженерного дела, знающий цену каждому шагу на заминированной земле.
Надежный тыл обеспечивает жена Наталья (познакомились в Чечне) и трое детей: дочери Евгения и Эмилия, сын Тамерлан. Рустам — пример отца и защитника не только для страны, но и для своей семьи.
24 февраля 2022 года подполковник Рустам Сайфуллин, командир 40-го инженерно-сапёрного полка, приступил к выполнению задач.
2 марта 2022 года при наведении переправы через реку Десну Рустам Сайфуллин получил первое ранение. После лечения он вернулся в своё подразделение.
10 мая 2022 года при обеспечении переправы через Северский Донец Сайфуллин получил второе тяжёлое ранение. Несмотря на него, он около 40 минут продолжал руководить подчинёнными до выполнения боевой задачи.
Рустам Сайфуллин: «Где Родина прикажет – там и будем».